Os objectivos específicos deste projecto são: 1) Identificar genes com DAE associados ao risco para cancro da mama. Já inciámos a fase I de um GWAS usando o DAE como um fenótipo quantitativo (dados preliminares). Nesta proposta, realizaremos a segunda fase do GWAS através de RNA-seq alvo em tecido normal de 50 pacientes com BC e 50 controlos, dos genes mais promissores da fase I, seguidos de estudos de associação caso-controlo. 2) Mapear as variantes cis-reguladoras (rSNPs) para os genes de risco identificados. A análise de DAE detecta o gene alvo da cis-regulação mas não sobre a localização do rSNP. Temos experiência em mapeamento com sucesso de variantes cis-reguladoras através da correlação da informação de DAE com dados de genótipos/haplótipos. 3) Caracterizar funcionalmente as novas variantes de risco. Para caracterizar o mecanismo de cis-regulação subjacente realizar-se-à in-silico, in vitro e in-vivo análises do melhores genes candidatos, em linhas celulares humanas da mama e tecido fresco.
Universidade do Algarve (Coordenador)
Instituto de Medicina Molecular
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