Projetos de I&D

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INTERGEN :Inovação de GWAS em cancro da mama através da integração de genómica funcional

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Os objectivos específicos deste projecto são: 1) Identificar genes com DAE associados ao risco para cancro da mama. Já inciámos a fase I de um GWAS usando o DAE como um fenótipo quantitativo (dados preliminares). Nesta proposta, realizaremos a segunda fase do GWAS através de RNA-seq alvo em tecido normal de 50 pacientes com BC e 50 controlos, dos genes mais promissores da fase I, seguidos de estudos de associação caso-controlo. 2) Mapear as variantes cis-reguladoras (rSNPs) para os genes de risco identificados. A análise de DAE detecta o gene alvo da cis-regulação mas não sobre a localização do rSNP. Temos experiência em mapeamento com sucesso de variantes cis-reguladoras através da correlação da informação de DAE com dados de genótipos/haplótipos. 3) Caracterizar funcionalmente as novas variantes de risco. Para caracterizar o mecanismo de cis-regulação subjacente realizar-se-à in-silico, in vitro e in-vivo análises do melhores genes candidatos, em linhas celulares humanas da mama e tecido fresco.

Objetivo principal
Reforçar a investigação, o desenvolvimento tecnológico e a inovação
Referência do projeto
ALG-01-0145-FEDER-030895 - INTERGEN
Tipologia
Investigação e Desenvolvimento
Data de aprovação
Data de início/fim
/
Data de prorrogação
Região de Intervenção
Algarve
Lisboa
Investigador principal
Joana Xavier
Programa financiador
FCT
CRESC Algarve 2020
Portugal 2020
União Europeia (FEDER)
Tipo de Financiamento
Fundos da União Europeia
Custo total elegível
236221.43
Custo total elegível UAlg
235721.43
Apoio financeiro da União Europeia
94488.57
Financiamento EU UAlg
94288.57
Apoio Financeiro Público Nac./Reg.
141732.86
Financiamento Nac./Reg. UAlg
141432.86
Entidades beneficiárias

Universidade do Algarve (Coordenador)
Instituto de Medicina Molecular

Financiamento